RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Kdm1bQ8CIG3 826 aa16.93■□□□□ 0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Caskin2Q8VHK1 1201 aa16.93■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Adamts1P97857 968 aa16.93■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Pbx4Q99NE9 378 aa16.93■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa16.93■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 SqleP52019 572 aa16.92■□□□□ 0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cfhr2Q4LDF6 332 aa16.92■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Anapc5Q8BTZ4 740 aa16.92■□□□□ 0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bpifb6Q8BU51 449 aa16.92■□□□□ 0.3
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Casq1-201ENSMUST00000003554 Spns2Q91VM4 549 aa16.92■□□□□ 0.3
Casq1-201ENSMUST00000003554 ParvaQ9EPC1 372 aa16.92■□□□□ 0.3
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