RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	UIP3	P39547	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YER188W	P40103	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	GLC8	P41818	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	BOR1	P53838	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	RUB1	Q03919	77 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	SHH3	Q04487	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	PAU3	P25610	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	HMX1	P32339	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	COA6	Q3E846	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	YAR068W	P39564	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	APS2	Q00381	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	ATC1	Q04005	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AMD1	YML035C	CUP2	P15315	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YBL071C	P38185	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	HSP10	P38910	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SAE3	P89114	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	BDH1	P39714	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	IRC22	P40006	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	CWC27	Q02770	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SRL1	Q08673	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	POM33	Q12164	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YOP1	Q12402	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	CCW14	O13547	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	INO2	P26798	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	DOG2	P38773	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	DOG1	P38774	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SAS2	P40963	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	MIC27	P50945	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YGR018C	P53211	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	NAT5	Q08689	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	ATP5	P09457	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	CSH1	P38287	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YCR022C	P25620	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YKL075C	P36083	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SRP14	P38985	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SUR2	P38992	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	TOM7	P53507	60 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SOH1	P38633	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	RAV2	Q03956	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	RRT1	P38192	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	MIG1	P27705	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YPS1	P32329	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YER134C	P40081	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YGR219W	P53307	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SDH7	Q04401	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SPG4	Q04438	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	MSC3	Q05812	728 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	GPI2	P46961	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YML122C	Q03207	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	RXT3	Q07458	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	NNK1	P36003	928 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	COX16	P47081	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	HAP3	P13434	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	MIC12	P38341	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	VPS55	P47111	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YNR071C	P53757	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	IZH1	Q03419	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	CSM4	Q08955	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	HTB2	P02294	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	AME1	P38313	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	TDA4	P47153	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	CPD1	P53314	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	HST4	P53688	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	YDR366C	P87287	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	HOR7	Q05827	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AMD1	YML035C	ICS2	P38284	255 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	YNL194C	P40169	301 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	SDS23	P53172	527 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	IZH3	Q07959	543 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	IRC23	Q08416	157 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	FZF1	P32805	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	SFT2	P38166	215 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	DUG3	P53871	357 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	TIM18	Q08749	192 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
AMD1	YML035C	CYC3	P06182	269 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms