RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	DOG1	P38774	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	GET2	P40056	285 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	MED7	Q08278	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	RRG8	Q06109	277 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	LAS17	Q12446	633 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	TMA17	Q12513	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	BDH1	P39714	382 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	PIC2	P40035	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	MRX11	Q03079	207 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	RKI1	Q12189	258 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	ICS2	P38284	255 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	UIP3	P39547	235 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	API2	Q04413	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	CNL1	Q06333	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	SRL1	Q08673	210 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YER085C	P40058	173 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YJL213W	P40896	331 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	DIA1	P54005	336 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	CYT2	Q00873	224 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	UBC7	Q02159	165 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	RAD6	P06104	172 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	VMA16	P23968	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YIL012W	P40551	113 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YFL015C	P43578	164 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	FIT2	Q08906	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YJL163C	P46996	555 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	MIX17	Q03667	156 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	DAD1	Q12248	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YPT10	P38146	199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	YGR149W	P48236	432 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	TRI1	Q05024	226 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	POM33	Q12164	279 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	STP4	Q07351	490 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	CUP2	P15315	225 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YRF1-4	YLR466W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	CSH1	P38287	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	HST4	P53688	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	ATP19	P81451	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	MRS1	P07266	363 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	RPB9	P27999	122 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	FUN14	P18411	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YGR018C	P53211	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	RAV2	Q03956	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SNA4	Q07549	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	ATO3	Q12359	275 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	RXT3	Q07458	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	AME1	P38313	324 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	TDA4	P47153	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YDL186W	P48568	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YCR022C	P25620	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	PAU7	P39545	55 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YDR366C	P87287	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	GTO3	Q04806	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	HUA1	P40325	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	CPD1	P53314	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	DAD4	P69851	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	FCY1	Q12178	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	MRPL44	P19956	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	PAM17	P36147	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	TOM7	P53507	60 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	AYT1	Q12226	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	HTB2	P02294	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SRP21	P32342	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SDS23	P53172	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	ATX2	Q12067	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	STF1	P01098	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	ANB1	P19211	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	VMA11	P32842	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	OST3	P48439	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	MIC26	P50087	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YGL118C	P53132	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	QRI5	P32344	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YFR045W	P43617	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	ERV14	P53173	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	HAP3	P13434	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	MRP49	P32388	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	OCA2	P53949	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	TIR1	P10863	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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