RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	UGX2	P32772	223 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	DAN1	P47178	298 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	APS2	Q00381	147 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	ELC1	Q03071	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YDL241W	Q07738	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YOR304C-A	O14468	76 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	MDM35	O60200	86 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YBL010C	P32788	280 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	TVP18	Q04767	167 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YGR269W	P40326	108 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	MPM1	P40364	252 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	AIM11	P87275	137 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	ARL3	Q02804	198 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YLR118C	Q12354	227 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	STF2	P16965	84 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YKR045C	P36138	183 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	FLX1	P40464	311 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	PHS1	P40857	217 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	RGM1	Q00453	211 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	IRC19	Q07843	230 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS0B	YLR048W	YCR050C	P25630	102 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	PEP8	P40335	379 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	ELP6	Q04868	273 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	FLO9	P39712	1322 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	DIE2	P50076	525 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	TMA23	Q03525	211 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	KEI1	Q06346	221 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	NRG2	P38082	220 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	SAE3	P89114	91 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	RUB1	Q03919	77 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	RPB7	P34087	171 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YHL042W	P38729	150 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	HPA3	P39979	161 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	AIM36	Q03798	255 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	SFT2	P38166	215 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	GAT4	P40569	121 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	MET31	Q03081	177 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	LDB18	Q07887	179 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YOR385W	Q08909	290 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	KIN28	P06242	306 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	ETR1	P38071	380 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YAL064W	P39711	94 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YCL001W-A	P87012	153 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	SOM1	Q05676	74 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	HUT1	Q12520	339 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS0B	YLR048W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	RAF1	Q06891	181 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	COX5B	P00425	151 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	RPB11	P38902	120 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	FYV5	P25585	152 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	YBR219C	P38317	127 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	KTI11	Q3E840	82 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	NMT1	P14743	455 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	QCR10	P37299	77 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	MDS3	P53094	1487 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	MRPL44	P19956	98 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	YEL014C	P39999	101 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	RCE1	Q03530	315 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	HSL1	P34244	1518 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	YLR422W	Q06409	1932 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	AVO2	Q04749	426 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	YLR042C	Q07990	161 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	ANB1	P19211	157 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RPS0B	YLR048W	HSP150	P32478	413 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	CWC27	Q02770	301 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	NAT5	Q08689	176 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	QCR8	P08525	94 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	IPT1	P38954	527 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.82	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47 ms