RNA–Protein interactions for RNA: YJL121C

RPE1, Transcript of D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase, yeast

Gene RPE1, Length 717 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPE1	YJL121C	TEM1	P38987	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YIR020C	P40575	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YFL054C	P43549	646 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	NCA3	P46955	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	TRI1	Q05024	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	CSI2	Q08054	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YLR302C	O13544	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RPE1	YJL121C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	MIG1	P27705	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RPB9	P27999	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	TDA4	P47153	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SBH2	P52871	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	CNL1	Q06333	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	GAT3	Q07928	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	PAU23	Q07987	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	MSA1	Q08471	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	PAU17	Q12370	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	ICS2	P38284	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	CSH1	P38287	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	HUA1	P40325	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	COX18	P53239	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YNR064C	P53750	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YNR071C	P53757	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	ATP19	P81451	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	CWC27	Q02770	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	FIT2	Q08906	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	CSM4	Q08955	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	DYN1	P36022	4092 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	TIR1	P10863	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YCR007C	P25354	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	ZRT1	P32804	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	HAC1	P41546	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YFL015C	P43578	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	PIR5	P46999	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YJL118W	P47022	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RAV2	Q03956	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	GIM5	Q04493	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	TVP18	Q04767	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SNA4	Q07549	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	ATP10	P18496	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	UTR5	P32630	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	BDH1	P39714	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YGL118C	P53132	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	TOM7	P53507	60 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	NDE2	Q07500	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RPL39	P04650	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YCR022C	P25620	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	FZF1	P32805	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	DOG2	P38773	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YER188W	P40103	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YDL183C	P48569	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YGL230C	P53074	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SDS23	P53172	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YGR151C	P53287	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	MRX11	Q03079	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SEC11	P15367	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YPT10	P38146	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SFT2	P38166	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YBL071C	P38185	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	BRP1	P53194	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YGR018C	P53211	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	RKI1	Q12189	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPE1	YJL121C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	MRS1	P07266	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	VMA11	P32842	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	CTR2	P38865	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPE1	YJL121C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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