RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeastyeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3YGL197W RGM1Q00453 211 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W AIM36Q03798 255 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SCP1Q08873 200 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W FCY1Q12178 158 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W RHO1P06780 209 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SGA1P08019 549 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ERD2P18414 219 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W MRPL44P19956 98 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W MXR2P25566 168 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W OCH1P31755 480 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YPL073CP40323 161 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YIL102CP40488 101 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W EMC5P40540 141 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W TTI2P47168 421 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YGR050CP53231 118 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W EST3Q03096 181 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YOR072WQ08486 104 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YPR202WQ08993 238 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SPO24Q3E752 67 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W HSP30P25619 332 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ERG24P32462 438 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W MIC12P38341 106 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W NSA2P40078 261 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YER135CP40082 130 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YER181CP40097 107 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YNL194CP40169 301 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ERG10P41338 398 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SOL1P50278 321 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W GEP7P53171 287 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W PEX31P53203 462 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YNL184CP53876 108 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W VBA1Q04301 562 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W PSF1Q12488 208 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SEC59P20048 519 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W UMP1P38293 148 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W CAT5P41735 233 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W CIS3P47001 227 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W THG1P53215 237 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W TMA23Q03525 211 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W OST6Q03723 332 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W EMI1Q04406 187 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W RAF1Q06891 181 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W HUT1Q12520 339 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W COA3Q3E7B2 85 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ODC2Q99297 307 aa0.99□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YPR117WQ06116 2489 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W REP2P03872 296 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W AIM18P38884 321 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ARP3P47117 449 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YIP3P53633 176 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YML096WQ04489 525 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ATG39Q06159 398 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ATG10Q07879 167 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W POM33Q12164 279 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YOR029WQ12243 111 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YLR361C-AQ3E795 98 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W MBF1O14467 151 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W HAP3P13434 144 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W PEX34P25584 144 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SRP21P32342 167 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W NRG2P38082 220 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ATX1P38636 73 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W PRS3P38689 320 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SBH1P52870 82 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W TOS8P53147 276 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W GPI19Q04082 140 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W DGA1Q08650 418 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YOR015WQ12169 119 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W MCT1Q12283 360 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YMR030W-AQ3E760 96 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ATG40Q99325 256 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W MATALPHA1P0CY06 175 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W HMLALPHA1P0CY07 175 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W BET1P22804 142 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W HSP12P22943 109 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W TRX3P25372 127 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W POF1P25576 258 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W NTF2P33331 125 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YOR062CP36025 268 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YFR054CP43622 192 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W GPI2P46961 280 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W ACT1P60010 375 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SNO1Q03144 224 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W VPS71Q03433 280 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YMR295CQ03559 197 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YDR249CQ03787 373 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W THI74Q04083 370 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W GEP5Q12393 293 aa0.98□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W OPI3P05375 206 aa0.97□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W HAP2P06774 265 aa0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.5 ms