RNA–Protein interactions for RNA: YCR098C

GIT1, Transcript of Plasma membrane permease, yeast

Gene GIT1, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GIT1	YCR098C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	BNS1	P50084	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU4	P53427	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YHP1	Q04116	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	MRS3	P10566	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	MIC26	P50087	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YGR026W	P53217	278 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YNR064C	P53750	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	ATP16	Q12165	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YPS3	Q12303	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	QCR9	P22289	66 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	INO2	P26798	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU13	P38725	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PHS1	P40857	217 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YJR015W	P47090	510 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	DAN1	P47178	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU10	Q03050	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU20	Q08322	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	PMU1	P36069	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	MOG1	P47123	218 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	ERV2	Q12284	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	DCN1	Q12395	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GIT1	YCR098C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	QRI5	P32344	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	SDH4	P37298	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	DER1	P38307	211 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	GTT1	P40582	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	BOR1	P53838	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	MIX17	Q03667	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	SEC59	P20048	519 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	AGA1	P32323	725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YKR045C	P36138	183 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	GPI18	P38211	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	NCA3	P46955	337 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	SHH3	Q04487	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	ATO3	Q12359	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YCR022C	P25620	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	MRPS9	P38120	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YBR013C	P38215	129 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YIL012W	P40551	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	HAC1	P41546	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	SBH2	P52871	88 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	IRC25	Q07951	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RAD28	Q12021	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	SAL1	D6W196	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	ACP1	P32463	125 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	TRS20	P38334	175 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	PAU15	P40585	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YJL213W	P40896	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	LST8	P41318	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	LCB3	P47013	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	DSK2	P48510	373 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	MIC27	P50945	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	MGA1	P53050	456 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YGR018C	P53211	109 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	FYV6	P53913	173 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	DPP1	Q05521	289 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	LOA1	Q06508	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	MCH1	Q07376	486 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	CSI2	Q08054	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	FCY1	Q12178	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	MDM10	P18409	493 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GIT1	YCR098C	YAR068W	P39564	161 aa		4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 80.7 ms