RNA–Protein interactions for RNA: RPR1

RPR1, Transcript of RNA component of nuclear RNase P, yeast

Gene RPR1, Length 369 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPR1	RPR1	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	DID2	P69771	204 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	YMR253C	Q04835	414 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	YDL242W	Q07746	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	FIT2	Q08906	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	CDC50	P25656	391 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	RRT13	P40042	185 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	SPI1	P40092	148 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	HUA1	P40325	198 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	MRX11	Q03079	207 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	AVO2	Q04749	426 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPR1	RPR1	HTB2	P02294	131 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	SPO13	P23624	291 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	PEX7	P39108	375 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YEA4	P40004	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YFL067W	P43537	175 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YJL028W	P47062	111 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	ATX2	Q12067	313 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YLR125W	Q12138	136 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YPL229W	Q99395	206 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	RTC6	O14464	93 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	CPT1	P17898	393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	QCR9	P22289	66 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	COQ3	P27680	312 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	MRPS16	Q02608	121 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	ATC1	Q04005	294 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	AHT1	P29589	182 aa		5	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YPT53	P36019	220 aa		5	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	KRE9	P39005	276 aa		5	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YNL217W	P40152	326 aa		5	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	KEG1	P43614	200 aa		5	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	MRS1	P07266	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YMR141C	P40211	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YCH1	P42937	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YDR366C	P87287	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	RRT15	Q3E811	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	TRS20	P38334	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	MRPL50	P53724	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	PLP1	Q04004	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	MRP10	O75012	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	YDR034C-A	P0C289	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	MRPL28	P36527	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	SVP26	P38869	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	DPP1	Q05521	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR1	RPR1	DIF1	O13577	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	AGA1	P32323	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	BRP1	P53194	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	NNK1	P36003	928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YDL183C	P48569	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YGL117W	P53133	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YNR066C	P53752	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	RAV2	Q03956	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	MGA1	P53050	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	CAF40	P53829	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	AIM34	Q03673	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	ACB1	P31787	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	DAD4	P69851	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YHR173C	P38864	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	POG1	P40473	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	EMC5	P40540	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	ACP1	P32463	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	AME1	P38313	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YML108W	Q03759	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YLR042C	Q07990	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	DGA1	Q08650	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	DAD1	Q12248	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPR1	RPR1	YCR023C	P25351	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPR1	RPR1	HMX1	P32339	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPR1	RPR1	YDR115W	Q04598	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPR1	RPR1	YOR015W	Q12169	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPR1	RPR1	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.1 ms