RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TMC2	Q8TDI7	906 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TLCD1	Q96CP7	247 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP41	Q9BYV8	373 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC19	Q9H756	370 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	FSCN2	O14926	492 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGB3	P05106	788 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TCF4	P15884	667 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA33	Q96N06	139 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	PYGB	P11216	843 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	SDC4	P31431	198 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NCALD	P61601	193 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC13	Q8NBP0	860 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	EXD1	Q8NHP7	514 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	KLC2	Q9H0B6	622 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-223	ENST00000639525	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF862	O60290	1169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	OAT	P04181	439 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	LCP1	P13796	627 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC8A3	P57103	927 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	NPNT	Q6UXI9	565 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	MBOAT7	Q96N66	472 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	HACL1	Q9UJ83	578 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	MYH3	P11055	1940 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SKI	P12755	728 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	MYBPC2	Q14324	1141 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	RCN1	Q15293	331 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	STOML1	Q9UBI4	398 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	PSTPIP1	O43586	416 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	GART	P22102	1010 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	ELK3	P41970	407 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	GCNT1	Q02742	428 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	TFDP2	Q14188	446 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	VWA5A	O00534	786 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP3K7	O43318	606 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	AVIL	O75366	819 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	CXCL8	P10145	99 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	GHR	P10912	638 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	MYL2	P10916	166 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	PTK6	Q13882	451 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	LY6K	Q17RY6	165 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	WNK4	Q96J92	1243 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	RASSF9	O75901	435 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP5H	O75947	161 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SERPINB3	P29508	390 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	AP1B1	Q10567	949 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO41	Q8TF61	875 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKL2	Q92772	493 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-223	ENST00000639525	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		12.32	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms