RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623321.3

ATRX-211, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATRX, Length 1,860 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-211ENST00000623321 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 AGPAT1Q99943 283 aa16.05■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CYP26A1O43174 497 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CD4P01730 458 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 KCNE1P15382 129 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ABCB4P21439 1286 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ATICP31939 592 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 ARMC5Q96C12 935 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 THAP2Q9H0W7 228 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 COG5Q9UP83 839 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa16.04■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FSBPO95073 299 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 KRT5P13647 590 aa16.03■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 DR1Q01658 176 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 BFSP2Q13515 415 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DSC3Q14574 896 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DUPD1Q68J44 220 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 BEST2Q8NFU1 509 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 FMO2Q99518 471 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DPH5Q9H2P9 285 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CENPHQ9H3R5 247 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 KLK14Q9P0G3 267 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 BRCA2P51587 3418 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 XPOTO43592 962 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ZNF623O75123 536 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SEC24CP53992 1094 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ZNF667Q5HYK9 610 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 PALB2Q86YC2 1186 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ERP44Q9BS26 406 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.03■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 NR2E1Q9Y466 385 aa16.03■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 E7EVH7 732 aa16.02■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 TRAPPC3O43617 180 aa16.02■□□□□ 0.16
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ATRX-211ENST00000623321 SELPP16109 830 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 RAB27AP51159 221 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 BPIFB4P59827 614 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 CNPY4Q8N129 248 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 HPDLQ96IR7 371 aa16.02■□□□□ 0.16
ATRX-211ENST00000623321 MGEA5O60502 916 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 MTA2O94776 668 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 NUDT17P0C025 328 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 SKIP12755 728 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 CYP11B1P15538 503 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 FNTAP49354 379 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 MBTPS1Q14703 1052 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.01■□□□□ 0.15
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ATRX-211ENST00000623321 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 UBR7Q8N806 425 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 ALG3Q92685 438 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 TLCD1Q96CP7 247 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.01■□□□□ 0.15
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ATRX-211ENST00000623321 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
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ATRX-211ENST00000623321 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 TRIP11Q15643 1979 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 A0A0U1RQF3 1178 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 GMNCA6NCL1 334 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 PHF2O75151 1096 aa16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ATRX-211ENST00000623321 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
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