RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 NENFQ9UMX5 172 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 EPOPA6NHQ4 379 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 VNN2O95498 520 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RB1P06400 928 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 BPIFB4P59827 614 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ERVFC1P60507 584 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CERS4Q9HA82 394 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MSRAQ9UJ68 235 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 LZTS1Q9Y250 596 aa22.25■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 THAP12O43422 761 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CTSAP10619 480 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC130P13994 396 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CD19P15391 556 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJB2P25686 324 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PCSK1P29120 753 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GLUD2P49448 558 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CDR2Q01850 454 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 KRT17Q04695 432 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PSMD5Q16401 504 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 FUKQ8N0W3 1084 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SAMD11Q96NU1 681 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 A0A087X0T9 212 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CLDN5O00501 218 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF263O14978 683 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 FAM228BP0C875 321 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PDE6CP51160 858 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PTPN14Q15678 1187 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CNGA2Q16280 664 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PKDCCQ504Y2 493 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF280DQ6N043 979 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 POF1BQ8WVV4 589 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TNIP3Q96KP6 325 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 OR6C75A6NL08 312 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 H3BNC9 293 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 H7C4K7 107 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 C2CD2LO14523 706 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 FSCN2O14926 492 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC172P0C7W6 258 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SGO2Q562F6 1265 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TTC30AQ86WT1 665 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GPR65Q8IYL9 337 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PCED1BQ96HM7 432 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.22■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MICAL2O94851 1124 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 IRS1P35568 1242 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CACNA2D1P54289 1103 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF677Q86XU0 584 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 MYLPFQ96A32 169 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms