RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 ERO1BQ86YB8 467 aa21.56■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.56■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TCHPQ9BT92 498 aa21.56■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 THAP12O43422 761 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PEX11AO75192 247 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 UNC5CO95185 931 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ECEL1O95672 775 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PCK1P35558 622 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 Q3C1V9 767 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 STK32AQ8WU08 396 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 IFT43Q96FT9 208 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PYGLP06737 847 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 POTEJP0CG39 1038 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TPBGLP0DKB5 382 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC29A2Q14542 456 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SPATA21Q7Z572 469 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RNF149Q8NC42 400 aa21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TTC36A6NLP5 189 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 OGTO15294 1046 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PRKCBP05771 671 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 CUL3Q13618 768 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 FBXO41Q8TF61 875 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 CHST7Q9NS84 486 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RAD23BP54727 409 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MCL1Q07820 350 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MAPK6Q16659 721 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RNF43Q68DV7 783 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MFSD5Q6N075 450 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TRIM4Q9C037 500 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MOB2Q70IA6 237 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TP73O15350 636 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PSTPIP1O43586 416 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 TAS2R40P59535 323 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 MYL6P60660 151 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ATL2Q8NHH9 583 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.047e-9■■■□□ 17.6
HDGFL2-208ENST00000616600 SCINQ9Y6U3 715 aa21.53■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PDLIM1O00151 329 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 PDHA1P08559 390 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RARGP13631 454 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 KRT17Q04695 432 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 DCLK3Q9C098 648 aa21.52■■□□□ 1.04
HDGFL2-208ENST00000616600 SMIM23A6NLE4 172 aa21.52■■□□□ 1.03
HDGFL2-208ENST00000616600 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
HDGFL2-208ENST00000616600 PROZP22891 400 aa21.52■■□□□ 1.03
HDGFL2-208ENST00000616600 MMP8P22894 467 aa21.52■■□□□ 1.03
HDGFL2-208ENST00000616600 MOGSQ13724 837 aa21.52■■□□□ 1.03
HDGFL2-208ENST00000616600 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.52■■□□□ 1.03
HDGFL2-208ENST00000616600 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
HDGFL2-208ENST00000616600 FAM136AQ96C01 138 aa21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms