RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ACCSQ96QU6 501 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PANX3Q96QZ0 392 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CYB561D2O14569 222 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 GNPATO15228 680 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MAGEB2O15479 319 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MAGEB3O15480 346 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ADCY3O60266 1144 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 FAM155BO75949 473 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MAP3K6O95382 1288 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CLPTM1O96005 669 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ITGA2BP08514 1039 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 FDX1P10109 184 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MUTP22033 750 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 GLRA2P23416 452 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CENPCQ03188 943 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PDK3Q15120 406 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 GSTA3Q16772 222 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SFT2D3Q587I9 215 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 WDR44Q5JSH3 913 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TMEM270Q6UE05 265 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 DPH6Q7L8W6 267 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TNS2Q63HR2 1409 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CAPN8A6NHC0 703 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 A8MXQ7 604 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 F5H423 210 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 H0YIN7 160 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 RARBP10826 455 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TCF4P15884 667 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 GCAP28676 217 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SLC1A1P43005 524 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 FAXCQ5TGI0 409 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 KRT39Q6A163 491 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 NLRX1Q86UT6 975 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 E5RJQ4 531 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TYROBPO43914 113 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PEX1O43933 1283 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TCEA3O75764 348 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TMCC1O94876 653 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PROSCO94903 275 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PROCP04070 461 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ADRB2P07550 413 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 VCLP18206 1134 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 RFX1P22670 979 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 BST1Q10588 318 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CNGA3Q16281 694 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 LHX8Q68G74 356 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 RNF148Q8N7C7 305 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-235ENST00000616247 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms