RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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ZNF548-208ENST00000597576 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA31D3P0C874 917 aa8.39□□□□□ -1.07
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ZNF548-208ENST00000597576 CYP3A5P20815 502 aa8.39□□□□□ -1.07
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