RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 C8AP07357 584 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CCDC130P13994 396 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 USP8P40818 1118 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 GCNT1Q02742 428 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 TMEM270Q6UE05 265 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 UBR7Q8N806 425 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 NEK11Q8NG66 645 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 TNIP3Q96KP6 325 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 MED10Q9BTT4 135 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 GANQ9H2C0 597 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 YIPF1Q9Y548 306 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 MYH10P35580 1976 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.94□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 FSD2A1L4K1 749 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CLDN5O00501 218 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 RFPL2O75678 378 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SEC24AO95486 1093 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CALCAP01258 141 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CD19P15391 556 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ADORA2BP29275 332 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ELF1P32519 619 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 MFAP3P55082 362 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 GPR17Q13304 367 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 UNC93AQ86WB7 457 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 STKLD1Q8NE28 680 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 WHAMMQ8TF30 809 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PCED1BQ96HM7 432 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PKMYT1Q99640 499 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PATJQ8NI35 1801 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.93□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 UCHL3P15374 230 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 KCNA5P22460 613 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 GPR15P49685 360 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 RAD23BP54727 409 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 DUSP4Q13115 394 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 TPGS2Q68CL5 300 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 FAM35AQ86V20 835 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 C12orf29Q8N999 325 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 KRT82Q9NSB4 513 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CDH22Q9UJ99 828 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ATP8B3O60423 1300 aa14.92□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CCL16O15467 120 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 CBFA2T2O43439 604 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 NOL4O94818 638 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ABLIM3O94929 683 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 TPM3P06753 285 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 FAM163BP0C2L3 166 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ATF2P15336 505 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 RFX1P22670 979 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 BDNFP23560 247 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 TWF1Q12792 350 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ADAM15Q13444 863 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 KCNC3Q14003 757 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.91□□□□□ -0.02
GGA3-216ENST00000583282 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms