RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PON1P27169 355 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SCFD2Q8WU76 684 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CAND2O75155 1236 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 C4orf22Q6V702 233 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 RNF181Q9P0P0 153 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SV2CQ496J9 727 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP9O95302 570 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 OCM2P0CE71 109 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 LAYNQ6UX15 382 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 RINLQ6ZS11 566 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SNX31Q8N9S9 440 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 GH1P01241 217 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CYBBP04839 570 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 GRB10Q13322 594 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 STMN3Q9NZ72 180 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 M0R3G1 203 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 AKT1P31749 480 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 OVGP1Q12889 678 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK7Q13164 816 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 WNK4Q96J92 1243 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CARD9Q9H257 536 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PSTPIP1O43586 416 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TADA2AO75478 443 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SERPIND1P05546 499 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK10P57789 538 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MICALL2Q8IY33 904 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MUC3BQ9H195 1237 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 VPS33BQ9H267 617 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TBX20Q9UMR3 447 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB7AO95365 584 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SGPL1O95470 568 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CTSHP09668 335 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC74AQ0VAA2 488 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PTPAQ15257 358 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf81C9J6K1 198 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ASMTLO95671 621 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MRGBPQ9NV56 204 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEB2O15479 319 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB14O75071 495 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PPP3CCP48454 512 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2H3Q13889 308 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB39O15060 712 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PTGER2P43116 358 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 NAGPAQ9UK23 515 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ARIH2O95376 493 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 INPP5DQ92835 1189 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FOPNLQ96NB1 174 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 COPAP53621 1224 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 CUL2Q13617 745 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.2■■□□□ 1.14
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