RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 NLRP12P59046 1061 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CCDC142Q17RM4 750 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CBWD6Q4V339 395 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ITFG1Q8TB96 612 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 SEMA4DQ92854 862 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 SDCBP2Q9H190 292 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ABCB6Q9NP58 842 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ASB3Q9Y575 518 aa23.12■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 NOTCH4Q99466 2003 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 A8MXQ7 604 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 HS6ST3Q8IZP7 471 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 RAB20Q9NX57 234 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.11■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 LAMP2P13473 410 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ATF6P18850 670 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 EPHA5P54756 1037 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 LEMD2Q8NC56 503 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 FGF13Q92913 245 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 LRRC3Q9BY71 257 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CDH7Q9ULB5 785 aa23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ZNF197O14709 1029 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 DCXO43602 365 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ALADP13716 330 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CYP2F1P24903 491 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CCR2P41597 374 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ITIH5Q86UX2 942 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 TRIM59Q8IWR1 403 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PSMG2Q969U7 264 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MYLPFQ96A32 169 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 BCO2Q9BYV7 579 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ASAH2Q9NR71 780 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 DACH1Q9UI36 760 aa23.09■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MICAL2O94851 1124 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 FMO5P49326 533 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PTPN21Q16825 1174 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 TMC8Q8IU68 726 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PCED1BQ96HM7 432 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 DOCK8Q8NF50 2099 aa23.08■■□□□ 1.29
NME3-210ENST00000567271 PMM2O15305 246 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ASGR2P07307 311 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CCDC192P0DO97 292 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 MYL4P12829 197 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 MAGEA11P43364 429 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GPR15P49685 360 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CYP27A1Q02318 531 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 VEPH1Q14D04 833 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 DDR2Q16832 855 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 WDR44Q5JSH3 913 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 UNC93AQ86WB7 457 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 NPAS3Q8IXF0 933 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GPR152Q8TDT2 470 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 GIPC2Q8TF65 315 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 ING5Q8WYH8 240 aa23.07■■□□□ 1.28
NME3-210ENST00000567271 KCNK12Q9HB15 430 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms