RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	NELL2	Q99435	816 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	LRRC3	Q9BY71	257 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SIX4	Q9UIU6	781 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	UBE4B	O95155	1302 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	PTPRJ	Q12913	1337 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	HUS1	O60921	280 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	CYP2J2	P51589	502 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	PPM1J	Q5JR12	505 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	USP25	Q9UHP3	1055 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	L1RE1	Q9UN81	338 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	HPSE	Q9Y251	543 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ASB3	Q9Y575	518 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	USP24	Q9UPU5	2620 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	KLRC4	O43908	158 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TNNC2	P02585	160 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TDGF1	P13385	188 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	FCAR	P24071	287 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SMARCB1	Q12824	385 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	MYO1E	Q12965	1108 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	STK4	Q13043	487 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TEAD2	Q15562	447 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TMC8	Q8IU68	726 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SMARCD2	Q92925	531 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ASB16	Q96NS5	453 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB23	Q9ULC3	237 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A1W2PRU2	124 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	PSMD2	Q13200	908 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ITIH5	Q86UX2	942 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR49	Q8IV35	697 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	PSMG2	Q969U7	264 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	HPDL	Q96IR7	371 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	GPR88	Q9GZN0	384 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	BRD9	Q9H8M2	597 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	EXOC1	Q9NV70	894 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	CHD6	Q8TD26	2715 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ATF6	P18850	670 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TNNI1	P19237	187 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	VIPR2	P41587	438 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SYK	P43405	635 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	NDUFA8	P51970	172 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TSPY1	Q01534	308 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	CYP24A1	Q07973	514 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	GIPC2	Q8TF65	315 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	FNBP1	Q96RU3	617 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	ACBD6	Q9BR61	282 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RNPS1-222	ENST00000567147	COL4A2	P08572	1712 aa		18.77	■□□□□ 0.59
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RNPS1-222	ENST00000567147	GDF9	O60383	454 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RNPS1-222	ENST00000567147	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
RNPS1-222	ENST00000567147	MYL7	Q01449	175 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RNPS1-222	ENST00000567147	DMWD	Q09019	674 aa		18.76	■□□□□ 0.59

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