RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561991.5

PKD1-224, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 964 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-224	ENST00000561991	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	FAM163B	P0C2L3	166 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	ATF6	P18850	670 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	CD58	P19256	250 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	CYP2F1	P24903	491 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	NDST1	P52848	882 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	LMO3	Q8TAP4	145 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	GPR152	Q8TDT2	470 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	MYLPF	Q96A32	169 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	MAFF	Q9ULX9	164 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	CLUH	O75153	1309 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	NOTCH4	Q99466	2003 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PKD1-224	ENST00000561991	XYLB	O75191	536 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	P4HA1	P13674	534 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	WHAMM	Q8TF30	809 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PCED1B	Q96HM7	432 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	KCNJ18	B7U540	433 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CLDN5	O00501	218 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PMM2	O15305	246 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PTMS	P20962	102 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CYP27A1	Q02318	531 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	APBA1	Q02410	837 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	KCNJ12	Q14500	433 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	NFKBIB	Q15653	356 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	WDR44	Q5JSH3	913 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MIIP	Q5JXC2	388 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	RTL10	Q7L3V2	364 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ACOT1	Q86TX2	421 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ITFG1	Q8TB96	612 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	GIPC2	Q8TF65	315 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	KAT5	Q92993	513 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CORO1B	Q9BR76	489 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	FANCL	Q9NW38	375 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	RHO	P08100	348 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	POU2F2	P09086	479 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CCR2	P41597	374 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CACNA2D1	P54289	1103 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	INCA1	Q0VD86	236 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	NCAPH	Q15003	741 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	DDR2	Q16832	855 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	POTEH	Q6S545	545 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MYADM	Q96S97	322 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	P4HA2	O15460	535 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CILP	O75339	1184 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	BDNF	P23560	247 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	FSHR	P23945	695 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ALDH1A3	P47895	512 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	SMARCB1	Q12824	385 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	CUL2	Q13617	745 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	ZNF394	Q53GI3	561 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	C12orf29	Q8N999	325 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PKD1-224	ENST00000561991	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		18.86	■□□□□ 0.61

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