RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	CACNB3	P54284	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ADAM8	P78325	824 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TLE1	Q04724	770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PICALM	Q13492	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	BRD3	Q15059	726 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TPP1	O14773	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	GRM6	O15303	877 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	POMC	P01189	267 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	VDR	P11473	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ALAS1	P13196	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	KCNJ5	P48544	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CLRN1	P58418	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	GPSM2	P81274	684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CDSN	Q15517	529 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MYOC	Q99972	504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SARG	Q9BW04	601 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	GOLIM4	O00461	696 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RAD17	O75943	681 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ZBED1	O96006	694 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIM27	P14373	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TYR	P14679	529 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RHCE	P18577	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	HK1	P19367	917 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	USP14	P54578	494 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB1A	P62820	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TMF1	P82094	1093 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RHD	Q02161	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FOXL1	Q12952	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PLS1	Q14651	629 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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