RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	BICDL2	A1A5D9	508 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BNC9	293 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NBN	O60934	754 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MOSPD3	O75425	235 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	MYBL2	P10244	700 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A1	P13866	664 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FPR1	P21462	350 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ECHS1	P30084	290 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GRK6	P43250	576 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBA4A	P68366	448 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF626	Q68DY1	528 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NAXE	Q8NCW5	288 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	PPM1M	Q96MI6	270 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	TAAR9	Q96RI9	348 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GREM2	Q9H772	168 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF521	Q96K83	1311 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AKAP13-223	ENST00000560957	KAT6A	Q92794	2004 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TPP1	O14773	563 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ORC4	O43929	436 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS23	O95084	383 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GCSH	P23434	173 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MCAM	P43121	646 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR3	P46089	330 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH1A3	P47895	512 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A9	P48067	706 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX10	P56693	466 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAND1	P57086	179 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT2	Q15019	361 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LLGL1	Q15334	1064 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ANO4	Q32M45	955 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PDXDC1	Q6P996	788 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RINL	Q6ZS11	566 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MED25	Q71SY5	747 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DPP9	Q86TI2	863 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LNX2	Q8N448	690 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FATE1	Q969F0	183 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NACC2	Q96BF6	587 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SGCZ	Q96LD1	299 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MRI1	Q9BV20	369 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PDP2	Q9P2J9	529 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GTW7	788 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL33	A6NCF5	533 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		F5H423	210 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		J3KRW8	73 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		K7ENM7	598 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	INSIG1	O15503	277 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR35	P0CG20	571 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MTHFD2	P13995	350 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	IL2RB	P14784	551 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FGFR4	P22455	802 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A2	P23975	617 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCSK1	P29120	753 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MTNR1B	P49286	362 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RAP2B	P61225	183 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CXADR	P78310	365 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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