RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	TUBB4A	P04350	444 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	MTMR1	Q13613	665 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	ODF1	Q14990	250 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	SPC25	Q9HBM1	224 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TIMM9-210	ENST00000557397		H0YIZ8	118 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	GNAI2	P04899	355 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CYP2C18	P33260	490 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PCID2	Q5JVF3	399 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ICE2	Q659A1	982 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	MYO1F	O00160	1098 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	KCNAB3	O43448	404 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	TLR5	O60602	858 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	LIPA	P38571	399 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	MAVS	Q7Z434	540 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	MIER2	Q8N344	545 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397		M0QYG6	137 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC16A6	O15403	523 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	KATNA1	O75449	491 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	DNAJB5	O75953	348 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ONECUT2	O95948	504 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PDC	P20941	246 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CCND1	P24385	295 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	HK3	P52790	923 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	NOG	Q13253	232 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	TREML2	Q5T2D2	321 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CPA6	Q8N4T0	437 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ABCF2	Q9UG63	623 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PPEF2	O14830	753 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF134	P52741	427 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PDE1A	P54750	535 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SP2	Q02086	613 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	TNKS	O95271	1327 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ADAMTS3	O15072	1205 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ENG	P17813	658 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CLCN2	P51788	898 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CYP4F2	P78329	520 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	LAYN	Q6UX15	382 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CHSY1	Q86X52	802 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PRR18	Q8N4B5	295 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	RGMA	Q96B86	450 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	HESX1	Q9UBX0	185 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	DCLK1	O15075	740 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	AHSG	P02765	367 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	TYR	P14679	529 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	MMP13	P45452	471 aa		5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
TIMM9-210	ENST00000557397	GALNT16	Q8N428	558 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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