RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 USP27XA6NNY8 438 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MAP3K7O43318 606 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 NDST1P52848 882 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 EFEMP1Q12805 493 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SMTNL2Q2TAL5 461 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TLR2O60603 784 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 LRP6O75581 1613 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MAML3Q96JK9 1138 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 A0A087X0B3 334 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SLC12A8A0AV02 714 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 GZMAP12544 262 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SCNN1GP51170 649 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TKTL1P51854 596 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 FUT2Q10981 343 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 GTF2H3Q13889 308 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 IFNL1Q8IU54 200 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 VPS11Q9H270 941 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.154e-16■■□□□ 13.2
LRP1-211ENST00000556356 NDFIP2Q9NV92 336 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CACNA1FO60840 1977 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CST8O60676 142 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PHF2O75151 1096 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ASMTLO95671 621 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MNAT1P51948 309 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 IRX4P78413 519 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 E2F4Q16254 413 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ATG16L1Q676U5 607 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 GPR20Q99678 358 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 THAP2Q9H0W7 228 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 DNAJC18Q9H819 358 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 F8VZ95 297 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 FOXP2O15409 715 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 XYLBO75191 536 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CAPSQ13938 189 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 USP38Q8NB14 1042 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SPATA18Q8TC71 538 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CASZ1Q86V15 1759 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SUN1O94901 812 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 MLH1P40692 756 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PMS2P54278 862 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CCZ1BP86790 482 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 NNTQ13423 1086 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TATDN2Q93075 761 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ADCY6O43306 1168 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 GTF2BQ00403 316 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 HIF1AQ16665 826 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PLAAQ9Y263 795 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 TWF1Q12792 350 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CD52P31358 61 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 GCNT1Q02742 428 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 DNAJC7Q99615 494 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 HACD3Q9P035 362 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PAK5Q9P286 719 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 AMACRQ9UHK6 382 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 LYPLA2O95372 231 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 APRTP07741 180 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 PTENP60484 403 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 SLC12A1Q13621 1099 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 DNAJC6O75061 913 aa15.96■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 GNRH1P01148 92 aa15.96■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 RTP1P59025 263 aa15.96■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 AMPD2Q01433 879 aa15.96■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 CASP8Q14790 479 aa15.96■□□□□ 0.15
LRP1-211ENST00000556356 ABHD15Q6UXT9 468 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms