RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	MORC3	Q14149	939 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	KIF22	Q14807	665 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876		Q6ZNX1	250 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PDSS2	Q86YH6	399 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	MORC4	Q8TE76	937 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	MED15	Q96RN5	788 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	5.11	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	MYADML2	A6NDP7	307 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	KIAA0355	O15063	1070 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	KPNA5	O15131	536 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	SUN1	O94901	812 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ANXA1	P04083	346 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	RARB	P10826	455 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	KCNA2	P16389	499 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	SERPINB3	P29508	390 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PRR16	Q569H4	304 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	LNX2	Q8N448	690 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	MED16	Q9Y2X0	877 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF785	A8K8V0	405 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	BTN3A1	O00481	513 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D4	O60343	1298 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	NUDT3	O95989	172 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PTH2R	P49190	550 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	CASP5	P51878	434 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ARFIP2	P53365	341 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	DPP9	Q86TI2	863 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	GPR35	Q9HC97	309 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	CASS4	Q9NQ75	786 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	STK32B	Q9NY57	414 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	DMTF1	Q9Y222	760 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RBM23-208	ENST00000553876	ZAR1L	A6NP61	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	RASA4B	C9J798	803 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	RASA4	O43374	803 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	GATA3	P23771	443 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SLC13A2	Q13183	592 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	GORAB	Q5T7V8	394 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	LPIN2	Q92539	896 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SCAMP4	Q969E2	229 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SGCZ	Q96LD1	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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