RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CEACAM1	P13688	526 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ATF6	P18850	670 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PLCG1	P19174	1290 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	UBA7	P41226	1012 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GALK1	P51570	392 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NCKAP1L	P55160	1127 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NLRP12	P59046	1061 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KRT85	P78386	507 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NUCB2	P80303	420 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CYP4F8	P98187	520 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NR1H3	Q13133	447 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLC39A14	Q15043	492 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CCDC6	Q16204	474 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MON1A	Q86VX9	555 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CPA6	Q8N4T0	437 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SPATA32	Q96LK8	384 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EBF3	Q9H4W6	596 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HPS4	Q9NQG7	708 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TDP1	Q9NUW8	608 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TBX20	Q9UMR3	447 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	C2CD2	Q9Y426	696 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688		A0A0B4J269	797 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	C4orf47	A7E2U8	309 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CYB561D2	O14569	222 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FAM189A1	O60320	539 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RNF40	O75150	1001 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SOAT2	O75908	522 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	YEATS4	O95619	227 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	BMP15	O95972	392 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EGF	P01133	1207 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	F11	P03951	625 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PLA2G4B	P0C869	781 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TNFSF9	P41273	254 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TAF6	P49848	677 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SLC12A3	P55017	1021 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CREB5	Q02930	508 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MCM6	Q14566	821 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	JADE1	Q6IE81	842 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SHC4	Q6S5L8	630 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FSIP1	Q8NA03	581 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CD101	Q93033	1021 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ATP2A3	Q93084	1043 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DHX58	Q96C10	678 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	FAM212A	Q96EL1	285 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	CALML4	Q96GE6	196 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MYRFL	Q96LU7	910 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	EDEM2	Q9BV94	578 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ECT2	Q9H8V3	914 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GVL5	298 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	KPNA7	A9QM74	516 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	TRAK2	O60296	914 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CS-233	ENST00000552688	PFKL	P17858	780 aa		7.37	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms