RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 TFCP2Q12800 502 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 VASNQ6EMK4 673 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZUG5 572 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 MOB2Q70IA6 237 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 PASD1Q8IV76 773 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 STPG3Q8N7X2 389 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf42Q96LP6 360 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 MEIS3Q99687 375 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 GALNT8Q9NY28 637 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 HOXC10Q9NYD6 342 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF236Q9UL36 1845 aa4.97□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM75PA6NK02 468 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MARCH6O60337 910 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ABLIM3O94929 683 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PFKMP08237 780 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 RGS2P41220 211 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MTNR1BP49286 362 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 RHBDL3P58872 404 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CD83Q01151 205 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TCP10Q12799 353 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PTPN21Q16825 1174 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TSPEARQ8WU66 669 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 AJUBAQ96IF1 538 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SCYL1Q96KG9 808 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SOX7Q9BT81 388 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 FLT1P17948 1338 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 RPTORQ8N122 1335 aa4.96□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SNAP23O00161 211 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SGPL1O95470 568 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A27O95847 323 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 KNG1P01042 644 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 HOXC6P09630 235 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ENPP1P22413 925 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MCAMP43121 646 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SOX10P56693 466 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TIMM10P62072 90 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ADCY1Q08828 1119 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PICALMQ13492 652 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 HS1BP3Q53T59 392 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TOR2AQ5JU69 321 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TTC38Q5R3I4 469 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD14CQ5VZR4 134 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC174Q6PII3 467 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 JADE3Q92613 823 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HDAC2-216ENST00000523628 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.95□□□□□ -1.62
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