RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 SERPINC1P01008 464 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CKMP06732 381 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 BDNFP23560 247 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 EPHB3P54753 998 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TPM4P67936 248 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ROR1Q01973 937 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE3AQ05086 875 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TWF1Q12792 350 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 UPP1Q16831 310 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC142Q17RM4 750 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 HVCN1Q96D96 273 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FANCLQ9NW38 375 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MARCH5Q9NX47 278 aa6.99□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PDXKO00764 312 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 HLA-DRAP01903 254 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC8A3P57103 927 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP24A1Q07973 514 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CD302Q8IX05 232 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CRELD1Q96HD1 420 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM209Q96SK2 561 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 HPSEQ9Y251 543 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TBX10O75333 385 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RHOBTB3O94955 611 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PCSK1P29120 753 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB15P59190 212 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CAMK1Q14012 370 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA1Q5VX52 437 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SV2AQ7L0J3 742 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 UROC1Q96N76 676 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 COX16Q9P0S2 106 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NCK2O43639 380 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MYL1P05976 194 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CCNE1P24864 410 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP2F1P24903 491 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NUMBP49757 651 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 WNT7BP56706 349 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SYCP1Q15431 976 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ASB2Q96Q27 587 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 IER2Q9BTL4 223 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ANO10Q9NW15 660 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PRU2 124 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CLDN5O00501 218 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 KLRC4O43908 158 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FZD6O60353 706 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GABRR2P28476 465 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PNPLA4P41247 253 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SYT15Q9BQS2 421 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBP1Q9H171 429 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ASAH2Q9NR71 780 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 HESX1Q9UBX0 185 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO10Q9HD67 2058 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 HMBSP08397 361 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 IRF1P10914 325 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 LMO2P25791 158 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GNA15P30679 374 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms