RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 CXorf38Q8TB03 319 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.2■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 DMXL1Q9Y485 3027 aa18.19■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 KRT19P08727 400 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 OSTM1Q86WC4 334 aa18.19■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.19■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 CCL26Q9Y258 94 aa18.19■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa18.18■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 CSH2P0DML3 217 aa18.18■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 RBP5P82980 135 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 MYL7Q01449 175 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 DMWDQ09019 674 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 CCINQ13939 588 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 STK38Q15208 465 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 DDR2Q16832 855 aa18.18■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 TXNDC8Q6A555 127 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 TMEM86AQ8N2M4 240 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 HPS3Q969F9 1004 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 FAM83CQ9BQN1 747 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 MTMR12Q9C0I1 747 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.18■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 RAB23Q9ULC3 237 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 USP18Q9UMW8 372 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 K7ESF4 209 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 HCRTO43612 131 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 PKMYT1Q99640 499 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 ABCB6Q9NP58 842 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 HPS4Q9NQG7 708 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 INTS13Q9NVM9 706 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 HRO43593 1189 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 HOXC13P31276 330 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 LHX1P48742 406 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 RUNX3Q13761 415 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 MON1AQ86VX9 555 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 LONP2Q86WA8 852 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 CBWD2Q8IUF1 395 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SPATA18Q8TC71 538 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 TNMDQ9H2S6 317 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 EBF3Q9H4W6 596 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 TDP1Q9NUW8 608 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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