RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2F1P24903 491 aa20.03■□□□□ 0.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 CYP4F8P98187 520 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPC3Q13507 836 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 NCOA4Q13772 614 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF699Q32M78 642 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.03■□□□□ 0.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.03■□□□□ 0.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.03■□□□□ 0.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 IL21Q9HBE4 155 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-218ENST00000511185 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 96.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.02■□□□□ 0.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.02■□□□□ 0.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 GDE1Q9NZC3 331 aa20.02■□□□□ 0.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF197O14709 1029 aa20.01■□□□□ 0.79
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SH3BP2-218ENST00000511185 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB16Q96NS5 453 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK13O15264 365 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 TACC1O75410 805 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 MICAL2O94851 1124 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 SMC2O95347 1197 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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SH3BP2-218ENST00000511185 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 DDR2Q16832 855 aa20■□□□□ 0.79
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SH3BP2-218ENST00000511185 MDH1BQ5I0G3 518 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM150AQ86TG1 271 aa20■□□□□ 0.79
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SH3BP2-218ENST00000511185 ADSSL1Q8N142 457 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6B3Q8NGW1 331 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 VRTNQ9H8Y1 702 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20■□□□□ 0.79
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SH3BP2-218ENST00000511185 CDH9Q9ULB4 789 aa20■□□□□ 0.79
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SH3BP2-218ENST00000511185 TADA3O75528 432 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DRAP01903 254 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ATICP31939 592 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 AP3M2P53677 418 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA2D1P54289 1103 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ORC1Q13415 861 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP221Q4G0U5 840 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF667Q5HYK9 610 aa19.99■□□□□ 0.79
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