RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 PDGFRBP09619 1106 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ALDH1A3P47895 512 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH8P55286 799 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 TPM4P67936 248 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 DUSP4Q13115 394 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 RFPL2O75678 378 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC24AO95486 1093 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 WEE2P0C1S8 567 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 RAP1GAPP47736 663 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CUL2Q13617 745 aa28.6■■■□□ 2.17
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SH3BP2-212ENST00000508338 EXOC3L4Q17RC7 722 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ATAD1Q8NBU5 361 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 LMO3Q8TAP4 145 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 JAKMIP2Q96AA8 810 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP295NLQ96MC4 621 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 NT5C1AQ9BXI3 368 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 SDCBP2Q9H190 292 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKAG3Q9UGI9 489 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ASB3Q9Y575 518 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP8B3O60423 1300 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 EPHB3P54753 998 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 GCNT1Q02742 428 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CRYBG2Q8N1P7 616 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 TATDN2Q93075 761 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 YIPF1Q9Y548 306 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 MYBPHLA2RUH7 354 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CILPO75339 1184 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF18P17022 549 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEA11P43364 429 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 NDST1P52848 882 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
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SH3BP2-212ENST00000508338 IQCEQ6IPM2 695 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 VSTM1Q6UX27 236 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 ITIH5Q86UX2 942 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 LEMD2Q8NC56 503 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 APOL5Q9BWW9 433 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP2-212ENST00000508338 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.58■■■□□ 2.17
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SH3BP2-212ENST00000508338 LRRN2O75325 713 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 VNN2O95498 520 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 TWF1Q12792 350 aa28.57■■■□□ 2.16
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SH3BP2-212ENST00000508338 KRT31Q15323 416 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.57■■■□□ 2.16
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SH3BP2-212ENST00000508338 ELMO3Q96BJ8 720 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 ELOVL4Q9GZR5 314 aa28.57■■■□□ 2.16
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SH3BP2-212ENST00000508338 PTPN2P17706 415 aa28.56■■■□□ 2.16
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SH3BP2-212ENST00000508338 MYLPFQ96A32 169 aa28.56■■■□□ 2.16
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SH3BP2-212ENST00000508338 NME7Q9Y5B8 376 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf16Q68DN1 1984 aa28.55■■■□□ 2.16
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SH3BP2-212ENST00000508338 FGF19O95750 216 aa28.54■■■□□ 2.16
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