RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 ASIC4Q96FT7 647 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 PKMYT1Q99640 499 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 GPR88Q9GZN0 384 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 VNN1O95497 513 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SRFP11831 508 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 ATF6P18850 670 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 CCNE1P24864 410 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 GTF2H1P32780 548 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 FAM171BQ6P995 826 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 PARM1Q6UWI2 310 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 GCNAQ96QF7 691 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TRIM49P0CI25 452 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TRIM49CP0CI26 452 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 LMO2P25791 158 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 CCR2P41597 374 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 ISM2Q6H9L7 571 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 FGF14Q92915 247 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 LRRC3Q9BY71 257 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 FBXL21Q9UKT6 434 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 HCRTO43612 131 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 HLA-DRAP01903 254 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 PDGFRBP09619 1106 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CDC25CP30307 473 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 GCLMP48507 274 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CDR1P51861 262 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MORC3Q14149 939 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 SHKBP1Q8TBC3 707 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 A0A1W2PRU2 124 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 BICDL2A1A5D9 508 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 A8MXQ7 604 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ECI2O75521 394 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CSH1P0DML2 217 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CSH2P0DML3 217 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 COL9A1P20849 921 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MAGEA11P43364 429 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 PPP3CAQ08209 521 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 TEAD2Q15562 447 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 KRT39Q6A163 491 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 VSTM1Q6UX27 236 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 FBXL6Q8N531 539 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 GIPC2Q8TF65 315 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MYLPFQ96A32 169 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CRTAC1Q9NQ79 661 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 BIN1O00499 593 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 NARSO43776 548 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MOSPD3O75425 235 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CYP2F1P24903 491 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 GABRR2P28476 465 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MXI1P50539 228 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CYP27A1Q02318 531 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ELSPBP1Q96BH3 223 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 TNIP3Q96KP6 325 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 CEP63Q96MT8 703 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ASB16Q96NS5 453 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 KXD1Q9BQD3 176 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ATXN3LQ9H3M9 355 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MFSD1Q9H3U5 465 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ZFP14Q9HCL3 533 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 WNT16Q9UBV4 365 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 ATP2C2O75185 946 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 GJA1P17302 382 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-206ENST00000507253 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms