RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 CPA4Q9UI42 421 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 RAD54BQ9Y620 910 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 VWC2LB2RUY7 222 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 TRIAP1O43715 76 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 RFPL1O75677 317 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJB5O75953 348 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 UNC5CO95185 931 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 HTR1BP28222 390 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 KCNJ5P48544 419 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ITIH3Q06033 890 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 EMC10Q5UCC4 262 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SLC39A13Q96H72 371 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 TAAR9Q96RI9 348 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 TTYH3Q9C0H2 523 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 KLK15Q9H2R5 256 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 H3BML4 177 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 UBXN7O94888 489 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 MYL1P05976 194 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 CD6P30203 668 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 GRIA3P42263 894 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 CACNA2D1P54289 1103 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 BRD3Q15059 726 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 PTPRRQ15256 657 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 LRRC41Q15345 812 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 VPS53Q5VIR6 699 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF575Q86XF7 245 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 NT5C1BQ96P26 610 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ASB6Q9NWX5 421 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 HESX1Q9UBX0 185 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.87□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00473A8K010 186 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ORC4O43929 436 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SOAT2O75908 522 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SCGB1D2O95969 90 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ELFN1P0C7U0 828 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF134P52741 427 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 NXPH1P58417 271 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 DAAM2Q86T65 1068 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 TMTC2Q8N394 836 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 KLC4Q9NSK0 619 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 WDR27A2RRH5 827 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC151A5D8V7 595 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 DCLK1O15075 740 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 GRPP07492 148 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 PDHA1P08559 390 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ATF3P18847 181 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 GTF2H3Q13889 308 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 FGL2Q14314 439 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 16.6
PDE4D-215ENST00000506510 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 FKBP10Q96AY3 582 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 FAM136AQ96C01 138 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 PBKQ96KB5 322 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-215ENST00000506510 COX11Q9Y6N1 276 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms