RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 COL20A1Q9P218 1284 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ASTN1O14525 1302 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CENPFP49454 3210 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF839A8K0R7 811 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ZBTB5O15062 677 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 LARGE1O95461 756 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CFBP00751 764 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 HMGCRP04035 888 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 KIF5BP33176 963 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 LIMS1P48059 325 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ITGA1P56199 1179 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 UBXN2AP68543 259 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 EPHA7Q15375 998 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 GPR158Q5T848 1215 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 FAM129CQ86XR2 697 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 MTMR8Q96EF0 704 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 DEFB118Q96PH6 123 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 GBP4Q96PP9 640 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 GORASP1Q9BQQ3 440 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 AMNQ9BXJ7 453 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 KCTD3Q9Y597 815 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 HTTP42858 3142 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ADAMTS3O15072 1205 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 MMEP08473 750 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 HOXC6P09630 235 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 C1QTNF9P0C862 333 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CALM1P0DP23 149 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CALM2P0DP24 149 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CALM3P0DP25 149 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SLC9A1P19634 815 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 PI3P19957 117 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CD40P25942 277 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ANAPC15P60006 121 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 FAPQ12884 760 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 PROSER1Q86XN7 944 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 DTX3Q8N9I9 347 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 CALML6Q8TD86 181 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ASB15Q8WXK1 588 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 EMC7Q9NPA0 242 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 FBXO40Q9UH90 709 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 NEMP1O14524 444 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 DVL2O14641 736 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 LSP1P33241 339 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 COPB2P35606 906 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 GNAQP50148 359 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 PHC1P78364 1004 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 AMPD3Q01432 767 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 PFKPQ01813 784 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 KCNA10Q16322 511 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ME3Q16798 604 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ARMCX2Q7L311 632 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 WDR48Q8TAF3 677 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 PGBD1Q96JS3 809 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 AIFM3Q96NN9 605 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 MAP3K14Q99558 947 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-204ENST00000504431 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms