RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.15□□□□□ -1.74
ANKRD28-213ENST00000498524 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.15□□□□□ -1.74
ANKRD28-213ENST00000498524 SUN2Q9UH99 717 aa4.15□□□□□ -1.74
ANKRD28-213ENST00000498524 SCN11AQ9UI33 1791 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PRSS47A8MTI9 375 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFRSF10BO14763 440 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SART1O43290 800 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FSBPO95073 299 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CYBBP04839 570 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LGALS2P05162 132 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FECHP22830 423 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AVPR2P30518 371 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SMARCB1Q12824 385 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LMAN2Q12907 356 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXO43Q4G163 708 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NELFCDQ8IXH7 590 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CPA6Q8N4T0 437 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HVCN1Q96D96 273 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM11Q96F44 468 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A0U1RQJ8 604 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CFAP73A6NFT4 308 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MYMKA6NI61 221 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MYO1FO00160 1098 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TCEA3O75764 348 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PYGBP11216 843 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFAIP3P21580 790 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FSHRP23945 695 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PSMC6P62333 389 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PPARDQ03181 441 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HIC1Q14526 733 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF135Q8IUD6 432 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 STAG2Q8N3U4 1231 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MGARPQ8TDB4 240 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NEUROD4Q9HD90 331 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PANK4Q9NVE7 773 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SEPT10Q9P0V9 454 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXL5Q9UKA1 691 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DSEQ9UL01 958 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SUFUQ9UMX1 484 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LRP3O75074 770 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CDK4P11802 303 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFRSF8P28908 595 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCK1P35558 622 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRPC1P48995 793 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RASSF2P50749 326 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ADCY2Q08462 1091 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM32Q13049 653 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PPP2R5CQ13362 524 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAM9Q13443 819 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MAPK6Q16659 721 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MUM1Q2TAK8 710 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 AGBL2Q5U5Z8 902 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TTI2Q6NXR4 508 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC51AQ86UW1 340 aa4.14□□□□□ -1.75
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