RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ASAH2	Q9NR71	780 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3R2	O00459	728 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MICAL2	O94851	1124 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	REC8	O95072	547 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF2	P15336	505 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	GJA1	P17302	382 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ALAS2	P22557	587 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT2	P35908	639 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	IDH3A	P50213	366 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSD	P51689	593 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TWF1	Q12792	350 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	UPP1	Q16831	310 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	COX20	Q5RI15	118 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MSANTD3	Q96H12	275 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	F5	P12259	2224 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PODXL	O00592	558 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	NEMF	O60524	1076 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ABLIM3	O94929	683 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC24A	O95486	1093 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CPB1	P15086	417 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR2	P41597	374 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	NAMPT	P43490	491 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX9	P48436	509 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	OSTN	P61366	133 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TEAD2	Q15562	447 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC6	Q16204	474 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZS52	159 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	WASF1	Q92558	559 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR88	Q9GZN0	384 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SYN3	O14994	580 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PML	P29590	882 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM4	P33991	863 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOA3	Q8NG57	546 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ESF4	209 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CHAD	O15335	359 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	DTNB	O60941	627 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	EFNA5	P52803	228 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LIMK1	P53667	647 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SCRN1	Q12765	414 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	CCIN	Q13939	588 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		11.83	□□□□□ -0.52

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