RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	SCN1A	P35498	2009 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	CCL16	O15467	120 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF18	P17022	549 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ITIH3	Q06033	890 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ORC1	Q13415	861 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ARID3A	Q99856	593 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM34-208	ENST00000485019	MBTPS2	O43462	519 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	XYLB	O75191	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CILP	O75339	1184 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	VNN2	O95498	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SERPINC1	P01008	464 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PON1	P27169	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	MFAP3	P55082	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TWF1	Q12792	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PLD1	Q13393	1074 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TSC2	P49815	1807 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SOAT2	O75908	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	BDNF	P23560	247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CYP2F1	P24903	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HOXA9	P31269	272 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	MTHFR	P42898	656 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF445	P59923	1031 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	APBA1	Q02410	837 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GCNT1	Q02742	428 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	UBXN1	Q04323	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KAT5	Q92993	513 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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