RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ING5Q8WYH8 240 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SNX25Q9H3E2 840 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ASB3Q9Y575 518 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ANHXE9PGG2 379 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MICAL2O94851 1124 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CEBPBP17676 345 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PIK3CAP42336 1068 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CDH8P55286 799 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 KRT39Q6A163 491 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 LEMD2Q8NC56 503 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PSMG2Q969U7 264 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CEP63Q96MT8 703 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SDCBP2Q9H190 292 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ABCB6Q9NP58 842 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ASAH2Q9NR71 780 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ZNF197O14709 1029 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 LRRN2O75325 713 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MYL4P12829 197 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CYP2F1P24903 491 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 STX17P56962 302 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MTMR3Q13615 1198 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 HTR4Q13639 388 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 TECTAO75443 2155 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 BICDL2A1A5D9 508 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 A8MXQ7 604 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CLSTN1O94985 981 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 RAP1GAPP47736 663 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 GPR15P49685 360 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 PAK1Q13153 545 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 TDGQ13569 410 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 PARM1Q6UWI2 310 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ITIH5Q86UX2 942 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 GIPC2Q8TF65 315 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 NXPE3Q969Y0 559 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.178e-9■■■■■ 39.5
ACTB-211ENST00000480301 GDE1Q9NZC3 331 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 STX10O60499 249 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 GJA1P17302 382 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ASPAP45381 313 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MXI1P50539 228 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 GPR152Q8TDT2 470 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SEMA4DQ92854 862 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 FGF14Q92915 247 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SLC35C1Q96A29 364 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MYLPFQ96A32 169 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 P4HA1P13674 534 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 VEPH1Q14D04 833 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 DDR2Q16832 855 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 GAREM2Q75VX8 874 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.36■■□□□ 1.17
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