RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 DCLK1O15075 740 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 HK1P19367 917 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SERPINF1P36955 418 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 COPAP53621 1224 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPARCL1Q14515 664 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM71BQ8TC56 605 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GCC1Q96CN9 775 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NELL2Q99435 816 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMOQ99835 787 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAGEH1Q9H213 219 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CASS4Q9NQ75 786 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 DACT1Q9NYF0 836 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 AQP12BA6NM10 295 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FOXS1O43638 330 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SH3BP5O60239 455 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLATP00750 562 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ITGA5P08648 1049 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 HSD3B1P14060 373 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 EGR1P18146 543 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CPT1AP50416 773 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LOXL3P58215 753 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 GRM1Q13255 1194 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARHGEF7Q14155 803 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTK2BQ14289 1009 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC29A2Q14542 456 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLA1AQ53H76 456 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 FCRL6Q6DN72 434 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LIN54Q6MZP7 749 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SNX27Q96L92 541 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRIB1Q96RU8 372 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 PNKPQ96T60 521 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRFN1Q9P244 771 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB3BP-211ENST00000478538 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 H7C4K7 107 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 M0R3H8 397 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB27BO00194 218 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 LEFTY2O00292 366 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRIM38O00635 465 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPR42O15529 346 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 VPS4BO75351 444 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 IDEP14735 1019 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 NHLH2Q02577 135 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF844Q08AG5 666 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 IQCB1Q15051 598 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 NPY5RQ15761 445 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 INSCQ1MX18 579 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 ALFQ53S48 1182 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 GGT6Q6P531 493 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRT73Q86Y46 540 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC150Q8NCX0 1101 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 POC1BQ8TC44 478 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 KCNC2Q96PR1 638 aa4.77□□□□□ -1.65
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAF1Q9H063 256 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms