RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	PRR33	A8MZF0	331 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	TACC1	O75410	805 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	PAPLN	O95428	1278 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	RHO	P08100	348 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	POU2F2	P09086	479 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CEP72	Q9P209	647 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	18.97	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	TRIO	O75962	3097 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	GNA14	O95837	355 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	FAM163B	P0C2L3	166 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	MYL4	P12829	197 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CYP27A1	Q02318	531 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	VEPH1	Q14D04	833 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	TAF12	Q16514	161 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CCDC142	Q17RM4	750 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CBWD6	Q4V339	395 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	WDR44	Q5JSH3	913 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	ING5	Q8WYH8	240 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	MYADM	Q96S97	322 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	RAB20	Q9NX57	234 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		18.96	■□□□□ 0.63
USP19-210	ENST00000465902	CCDC192	P0DO97	292 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ITFG1	Q8TB96	612 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	GIPC2	Q8TF65	315 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	SEMA4D	Q92854	862 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	SLC35C1	Q96A29	364 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	SDCBP2	Q9H190	292 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ASAH2	Q9NR71	780 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ZNF197	O14709	1029 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	LRRN2	O75325	713 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CYP2F1	P24903	491 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	FAM171B	Q6P995	826 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ITIH5	Q86UX2	942 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	GPR152	Q8TDT2	470 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MYLPF	Q96A32	169 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	PKMYT1	Q99640	499 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ASB3	Q9Y575	518 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	NME7	Q9Y5B8	376 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	PTPRD	P23468	1912 aa		18.94	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ASGR2	P07307	311 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CD58	P19256	250 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ASPA	P45381	313 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	FMO5	P49326	533 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CETN1	Q12798	172 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	EDA	Q92838	391 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	FGF13	Q92913	245 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	TNIP3	Q96KP6	325 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ABCB6	Q9NP58	842 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CDH7	Q9ULB5	785 aa		18.93	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	LAMP2	P13473	410 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ATF6	P18850	670 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	BDNF	P23560	247 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	GPR15	P49685	360 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	NDST1	P52848	882 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	LRMP	Q12912	555 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ORC1	Q13415	861 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	DDR2	Q16832	855 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		18.92	■□□□□ 0.62

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