RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 ASB3Q9Y575 518 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MYO10Q9HD67 2058 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF197O14709 1029 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 SOAT2O75908 522 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 RAP1GAPP47736 663 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 TAF12Q16514 161 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 WDR44Q5JSH3 913 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 FAM171BQ6P995 826 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 LEMD2Q8NC56 503 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MYADMQ96S97 322 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ASAH2Q9NR71 780 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 RAB20Q9NX57 234 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 DCXO43602 365 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ATP2C2O75185 946 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC192P0DO97 292 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 SLC35C1Q96A29 364 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PKMYT1Q99640 499 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ABCB6Q9NP58 842 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CDH7Q9ULB5 785 aa22.87■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 MYL4P12829 197 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 LAMP2P13473 410 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CYP2F1P24903 491 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CYP27A1Q02318 531 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CBWD6Q4V339 395 aa22.86■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ITFG1Q8TB96 612 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.86■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 TNIP3Q96KP6 325 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.85■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 SEMA4DQ92854 862 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 FGF13Q92913 245 aa22.85■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 SDCBP2Q9H190 292 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.85■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 NOTCH4Q99466 2003 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ASPAP45381 313 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 FMO5P49326 533 aa22.84■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 NME7Q9Y5B8 376 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 LRRN2O75325 713 aa22.83■■□□□ 1.25
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ABCD4-202ENST00000460308 ASGR2P07307 311 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ATF6P18850 670 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PTPN21Q16825 1174 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 UNC93AQ86WB7 457 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 PCED1BQ96HM7 432 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 BCO2Q9BYV7 579 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.83■■□□□ 1.25
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