RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450865.2

VNN3-210, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene VNN3, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-210ENST00000450865 ATP1A3P13637 1013 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CYP3A5P20815 502 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CA8P35219 290 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PPM1AP35813 382 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 SLC11A1P49279 550 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CLCNKBP51801 687 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 BCAR1P56945 870 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ENPEPQ07075 957 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 DSC1Q08554 894 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 MYO1EQ12965 1108 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 NCAPHQ15003 741 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 IQCB1Q15051 598 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 KRT31Q15323 416 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ZNF699Q32M78 642 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 XKR4Q5GH76 650 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 KRT39Q6A163 491 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 SYT9Q86SS6 491 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ELOA3Q8NG57 546 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 RABGGTAQ92696 567 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TMEM169Q96HH4 297 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 MIOSQ9NXC5 875 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 GCNT4Q9P109 453 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 NRP1O14786 923 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 B4GALT3O60512 393 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 B3GAT3O94766 335 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 HLA-DRAP01903 254 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TPM3P06753 285 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 GTF2H1P32780 548 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PNPLA4P41247 253 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 FMO5P49326 533 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TAF6P49848 677 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TNNC1P63316 161 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CLDN10P78369 228 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 RBP5P82980 135 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PPP3CAQ08209 521 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 NAB2Q15742 525 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ZACNQ401N2 412 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 SV2CQ496J9 727 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CBWD6Q4V339 395 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 VWA3BQ502W6 1294 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TIFAQ96CG3 184 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 VPS16Q9H269 839 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 NDST4Q9H3R1 872 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CWH43Q9H720 699 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 CERS4Q9HA82 394 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 F8W810 466 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PPEF2O14830 753 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TRAPPC3O43617 180 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 TADA2AO75478 443 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ALDH2P05091 517 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ODC1P11926 461 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 P4HA1P13674 534 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 ZNF18P17022 549 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 LRPAP1P30533 357 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-210ENST00000450865 PLXNA3P51805 1871 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms