RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 EYSQ5T1H1 3165 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 MTMR11A4FU01 709 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 NCK2O43639 380 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 VNN2O95498 520 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 RAD23BP54727 409 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 RTL10Q7L3V2 364 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 NEK11Q8NG66 645 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 STK33Q9BYT3 514 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 ABCB6Q9NP58 842 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 ATP2C2O75185 946 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 PAPLNO95428 1278 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 PAEPP09466 180 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM270Q6UE05 265 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 PALB2Q86YC2 1186 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 CEP72Q9P209 647 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 DPP7Q9UHL4 492 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-201ENST00000425753 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 GLP2RO95838 553 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 EPCAMP16422 314 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ARPP19P56211 112 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 JAM2P57087 298 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC142Q17RM4 750 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ACOT1Q86TX2 421 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 MYLPFQ96A32 169 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 IQCDQ96DY2 449 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PCED1BQ96HM7 432 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.7■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 F8VZ95 297 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ADCY1Q08828 1119 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ORC1Q13415 861 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ADAM15Q13444 863 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PTPN21Q16825 1174 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF394Q53GI3 561 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 CASP10Q92851 521 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PLXNA3P51805 1871 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 HOXA9P31269 272 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 NUP58Q9BVL2 599 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 MYO6Q9UM54 1294 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 SEC24AO95486 1093 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 POU2F2P09086 479 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 MAGEA11P43364 429 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 VSTM4Q8IW00 320 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 FUKQ8N0W3 1084 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 C12orf29Q8N999 325 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM5Q9C035 493 aa21.67■■□□□ 1.06
TSTA3-201ENST00000425753 A0A1W2PQJ5 194 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms