RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 UBR7Q8N806 425 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 WHAMMQ8TF30 809 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 SIX2Q9NPC8 291 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 PRRG1O14668 218 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 SEC24AO95486 1093 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 HOXA9P31269 272 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 MFAP3P55082 362 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 UBXN1Q04323 297 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 ABCB6Q9NP58 842 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 PTPRDP23468 1912 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-211ENST00000424766 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 SERPINC1P01008 464 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 C8AP07357 584 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 FANCCQ00597 558 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 DUSP4Q13115 394 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ACOT1Q86TX2 421 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 KAT5Q92993 513 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 S1PR5Q9H228 398 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.95■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 A0A1B0GTH6 734 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 KCNA5P22460 613 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 RAD23BP54727 409 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ITIH3Q06033 890 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 TWNKQ96RR1 684 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CD207Q9UJ71 328 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 MYH10P35580 1976 aa21.94■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 REV3LO60673 3130 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 RFPL2O75678 378 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 POU2F2P09086 479 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 MAGEA11P43364 429 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 APBA1Q02410 837 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 RNF214Q8ND24 703 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 MYLPFQ96A32 169 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 PCED1BQ96HM7 432 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 TEX33O43247 280 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 LRG1P02750 347 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 RFX1P22670 979 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ALDH1A3P47895 512 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CYP27A1Q02318 531 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 PLD1Q13393 1074 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 NR1I3Q14994 352 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 SYCP1Q15431 976 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 CCDC142Q17RM4 750 aa21.92■■□□□ 1.1
PMS1-211ENST00000424766 ZNF394Q53GI3 561 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms