RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 STYXL1Q9Y6J8 313 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC5CO95185 931 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 EDN1P05305 212 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNB1P14635 433 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CA4P22748 312 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMC4P43686 418 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 OGDHQ02218 1023 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SPARCL1Q14515 664 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 XKR3Q5GH77 459 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKMY2Q8IV38 441 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND1AQ8TEH3 1009 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC25Q96NG3 672 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CGRRF1Q99675 332 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRD1A4D1F6 860 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GLRA2P23416 452 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 NR1H3Q13133 447 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ERICH1Q86X53 443 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 VSIG1Q86XK7 387 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GUA9 196 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PPM1 405 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE5A6NIY4 337 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SGK1O00141 431 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CCND1P24385 295 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR72Q3MJ13 1102 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC24Q6P3W2 148 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 STARD13Q9Y3M8 1113 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 DIAPH2O60879 1101 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CNMDO75829 334 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 BRD2P25440 801 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SETDB1Q15047 1291 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf88Q9H8K7 445 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 UBN1Q9NPG3 1134 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CHKBQ9Y259 395 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 NFASCO94856 1347 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PIAS1O75925 651 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CST3P01034 146 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP4AP20648 1035 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TARSP26639 723 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC1A5Q15758 541 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM237Q96Q45 408 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PORCNQ9H237 461 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTN6Q9UQ52 1028 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 OAZ1P54368 228 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 VCPP55072 806 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNLT1P63172 113 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC15Q0P6D6 951 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 NAA25Q14CX7 972 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MORF4L2Q15014 288 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SLFN12LQ6IEE8 588 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TDRPQ86YL5 185 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC8CQ8TDW0 803 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 IMPG2Q9BZV3 1241 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 RBPJLQ9UBG7 517 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP11AP98196 1134 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GAD2Q05329 585 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MTM1Q13496 603 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 OASLQ15646 514 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LY6KQ17RY6 165 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP4A22Q5TCH4 519 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPUQ71F23 418 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TXLNGQ9NUQ3 528 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0B4J269 797 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEB2O15479 319 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LDHAP00338 332 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MCL1Q07820 350 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 MOGSQ13724 837 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TFDP3Q5H9I0 405 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM50Q86XT4 487 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB10Q96DT7 871 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC37BQ96QE4 947 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 HAO1Q9UJM8 370 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 USH1CQ9Y6N9 552 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 HTTP42858 3142 aa19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ALOX15BO15296 676 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CALB1P05937 261 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCD1P33897 745 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PDK4Q16654 411 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 HHATQ5VTY9 493 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms