RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PARM1Q6UWI2 310 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ITIH5Q86UX2 942 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMG2Q969U7 264 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 SYT15Q9BQS2 421 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC3Q9BY71 257 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 GDE1Q9NZC3 331 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM221A6NGB7 291 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R296 226 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CLSTN1O94985 981 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 HLA-DRAP01903 254 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CEBPBP17676 345 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2F1P24903 491 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2H1P32780 548 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH8P55286 799 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GIPC2Q8TF65 315 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF4BQ92750 862 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 MOSPD3O75425 235 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GJA1P17302 382 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ATF6P18850 670 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 HTR4Q13639 388 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 VEPH1Q14D04 833 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC142Q17RM4 750 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TMC8Q8IU68 726 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR152Q8TDT2 470 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 NELFBQ8WX92 580 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 FGF14Q92915 247 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCB6Q9NP58 842 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 NME7Q9Y5B8 376 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 A8MXQ7 604 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 P4HA1P13674 534 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3CAP42336 1068 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF12Q16514 161 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 MTSS1LQ765P7 747 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ASIC4Q96FT7 647 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 STX10O60499 249 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR15P49685 360 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TEAD2Q15562 447 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DDR2Q16832 855 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT39Q6A163 491 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SDCBP2Q9H190 292 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PRU2 124 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 BICDL2A1A5D9 508 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 FGF19O95750 216 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 RAP1GAPP47736 663 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP27A1Q02318 531 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TTI2Q6NXR4 508 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GAREM2Q75VX8 874 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 MYLPFQ96A32 169 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP63Q96MT8 703 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GBP4Q96PP9 640 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR88Q9GZN0 384 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 BDNFP23560 247 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRR2P28476 465 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-204ENST00000416021 STX17P56962 302 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms