RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFP42Q96MM3 310 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF560Q96MR9 790 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 APLP1P51693 650 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PAK2Q13177 524 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PDCLQ13371 301 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CHST12Q9NRB3 414 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 KPNA7A9QM74 516 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 RARAP10276 462 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TCF4P15884 667 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ITGA7Q13683 1181 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB9Q96C00 473 aa22.81■■□□□ 1.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 PLVAPQ9BX97 442 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 SYNCQ9H7C4 482 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 F8VP50 259 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 FSCN2O14926 492 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 HCRTO43612 131 aa22.8■■□□□ 1.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 PNPLA4P41247 253 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 GABRB2P47870 512 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TAF6P49848 677 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 EMBQ6PCB8 327 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF180Q86T96 592 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 GPR182O15218 404 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 FGFR1P11362 822 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT3P12035 628 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ACLYP53396 1101 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 DR1Q01658 176 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC27Q6P3X3 843 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CAVIN3Q969G5 261 aa22.8■■□□□ 1.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ST7Q9NRC1 585 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM153BP0C7A2 387 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CD52P31358 61 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CHRNA3P32297 505 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 STILQ15468 1287 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP1B1Q16678 543 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM153CQ494X1 144 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 SV2CQ496J9 727 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.79■■□□□ 1.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 LPPQ93052 612 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PADI3Q9ULW8 664 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 HTTP42858 3142 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CUL1Q13616 776 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PKDCCQ504Y2 493 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC30AQ86WT1 665 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 GAD1Q99259 594 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-204ENST00000412806 DAPK3O43293 454 aa22.77■■□□□ 1.24
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