RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CYBBP04839 570 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FIGNQ5HY92 759 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf20Q8ND61 904 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 E2F7Q96AV8 911 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C18orf8Q96DM3 657 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF560Q96MR9 790 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINB12Q96P63 405 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SCN3BQ9NY72 215 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 POLIQ9UNA4 740 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PJA2O43164 708 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KLHL2O95198 593 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GYS1P13807 737 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ITIH4Q14624 930 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TTI2Q6NXR4 508 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 LAYNQ6UX15 382 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HORMAD1Q86X24 394 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KRT35Q92764 455 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PGBD4Q96DM1 585 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TPST1O60507 370 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PDE5AO76074 875 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RPA1P27694 616 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PSMC5P62195 406 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 STILQ15468 1287 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CHI3L2Q15782 390 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DNAAF5Q86Y56 855 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GINS4Q9BRT9 223 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 THAP2Q9H0W7 228 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PIDD1Q9HB75 910 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.931e-6■■■□□ 16.9
PTPRM-202ENST00000400053 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CDC25CP30307 473 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 LDHDQ86WU2 507 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DCDC2Q9UHG0 476 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SNTNA6NMZ2 147 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SMAPO00193 183 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ENTPD3O75355 529 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ARL4DP49703 201 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINB9P50453 376 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GPD1LQ8N335 351 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB39O15060 712 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RBP3P10745 1247 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PRLRP16471 622 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NCKAP1LP55160 1127 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CDK17Q00537 523 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DSG1Q02413 1049 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 UBE3AQ05086 875 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MROH9Q5TGP6 573 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP99D6REC4 459 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 M0R3G1 203 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GRB10Q13322 594 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TNIP3Q96KP6 325 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MCEEQ96PE7 176 aa9.24□□□□□ -0.93
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