RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYAQ5MJ70 313 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TEKT4Q8WW24 435 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 DDIT4Q9NX09 232 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TFR2Q9UP52 801 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA9O76027 345 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 VDRP11473 427 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 IRAK1P51617 712 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MTM1Q13496 603 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 NTRK3Q16288 839 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB12Q96P63 405 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TECPR2O15040 1411 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CASP4P49662 377 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SRLQ86TD4 932 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 RALBP11234 206 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 Q4G0T1 1027 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC6Q86X45 466 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MROH8Q9H579 483 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PKP3Q9Y446 797 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 USP32Q8NFA0 1604 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 KRT16P08779 473 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A2P50443 739 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC4P56524 1084 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 E2F7Q96AV8 911 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CYP11B1P15538 503 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FDFT1P37268 417 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SGPL1O95470 568 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 KIZQ2M2Z5 673 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 POTEAQ6S8J7 498 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf19Q8IY42 314 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 B3GAT3O94766 335 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FAM107AO95990 144 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SEZ6Q53EL9 994 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 F9P00740 461 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ODC1P11926 461 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CLCN3P51790 818 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TAGAPQ8N103 731 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 M0QYT0 321 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2A2P52657 109 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CNGA3Q16281 694 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 RNF180Q86T96 592 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH1A3P47895 512 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CCNJLQ8IV13 435 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1E1P36543 226 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 HSD17B3P37058 310 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K10Q02779 954 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 KRT72Q14CN4 511 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf89Q6UX73 402 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 WDCPQ9H6R7 721 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CGRRF1Q99675 332 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 YIPF3Q9GZM5 350 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms