RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FSCN2O14926 492 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KPNA5O15131 536 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MED24O75448 989 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRT37O76014 449 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMC2O95347 1197 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CPP00450 1065 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HRGP04196 525 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PEX2P28328 305 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASIC1P78348 528 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAP1Q01518 475 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OCRLQ01968 901 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTSQ03393 145 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CUL4BQ13620 913 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCSK7Q16549 785 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFHBQ8N7U6 833 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COPS5Q92905 334 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IWS1Q96ST2 819 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS11Q9H270 941 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS45Q9NRW7 570 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RLFQ13129 1914 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H0Y8X5 98 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CA12O43570 354 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STRNO43815 780 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMD10O75832 226 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TUSC2O75896 110 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTGS1P23219 599 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPM1AP35813 382 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMC4P43686 418 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RXRGP48443 463 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCT5P48643 541 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMC6P62333 389 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TAF3Q5VWG9 929 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDHR1Q96JP9 859 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MBOAT7Q96N66 472 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERINC2Q96SA4 455 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASB14A6NK59 587 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BECN2A8MW95 431 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DVL2O14641 736 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNK3O14649 394 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SIN3BO75182 1162 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALDH2P05091 517 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AKAP5P24588 427 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRK6P43250 576 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR85P60893 370 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMTNQ08495 405 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARMCX2Q7L311 632 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNK18Q7Z418 384 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC140Q96MF4 163 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIGD1Q96MW7 591 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LXNQ9BS40 222 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VAV3Q9UKW4 847 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms