RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340477.9

SYNE4-202, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE4, Length 1,004 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-202ENST00000340477 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 STX17P56962 302 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 WDR44Q5JSH3 913 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 GCNAQ96QF7 691 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MYADMQ96S97 322 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CEP72Q9P209 647 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ATP8B3O60423 1300 aa20.5■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MYL4P12829 197 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 LAMP2P13473 410 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CYP27A1Q02318 531 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CETN1Q12798 172 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MTSS1LQ765P7 747 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ITFG1Q8TB96 612 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ING5Q8WYH8 240 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 PSMG2Q969U7 264 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 NXPE3Q969Y0 559 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 TNIP3Q96KP6 325 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 GDE1Q9NZC3 331 aa20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SOAT2O75908 522 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MICAL2O94851 1124 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CCDC192P0DO97 292 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 LMO2P25791 158 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CDR1P51861 262 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 FGF13Q92913 245 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MYLPFQ96A32 169 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MUC3AQ02505 3323 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 HCRTO43612 131 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ASGR2P07307 311 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ANXA13P27216 316 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 RAP1GAPP47736 663 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 FAM171BQ6P995 826 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 TTC39CQ8N584 583 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 PKMYT1Q99640 499 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 181.9
SYNE4-202ENST00000340477 RAB20Q9NX57 234 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 NOTCH4Q99466 2003 aa20.47■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ATP2C2O75185 946 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CEBPBP17676 345 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ATF6P18850 670 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CYP2F1P24903 491 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MAGEA11P43364 429 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 EPHA5P54756 1037 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CDH8P55286 799 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 NLRP12P59046 1061 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ZXDAP98168 799 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 TDGQ13569 410 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 VSTM1Q6UX27 236 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 GPT2Q8TD30 523 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 GIPC2Q8TF65 315 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 EDAQ92838 391 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SLC35C1Q96A29 364 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 KCNK12Q9HB15 430 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 MYO10Q9HD67 2058 aa20.46■□□□□ 0.87
SYNE4-202ENST00000340477 PTPRDP23468 1912 aa20.45■□□□□ 0.86
SYNE4-202ENST00000340477 TRIM66O15016 1216 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms